※54회 대통령배 전국고교야구대회 참가 고교는 아래 지역에 있는 학교가 출전을 한다.

■서울 지역

↳배명고등학교, 서울디자인고등학교, 선린인터넷고등학교, 성남고등학교, 성지고등학교, 신일고등학교

■부산 지역

↳개성고등학교, 경남고등학교, 부산고등학교

■인천 지역

↳인천고등학교, 동산고등학교, 제물포고등학교

■광주 지역

↳광주동성고등학교, 광주진흥고등학교

■대구 지역

↳상원고등학교

■대전 지역

■울산 지역

↳울산공업고등학교

■경기 지역

↳상우고등학교, 소래고등학교, 신흥고등학교, 율곡고등학교, 장안고등학교, 충훈고등학교

■강원 지역

↳강릉고등학교, 설악고등학교

■충북 지역

■충남 지역

↳공주고등학교, 북일고등학교

■전북 지역

■전남 지역

↳순천효천고등학교

■경북 지역

↳도개고등학교

■경남 지역

↳마산고등학교, 마산용마고등학교

■제주 지역